Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc146E9Q9F7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc146E9Q9F7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms