Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm20518E9Q548 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20518E9Q548 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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