Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms