Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc175E9PVB3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms