Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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