Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms