Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clrn2B2RVW2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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