Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms