Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SktA2AQ25 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SktA2AQ25 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms