Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ttll9A2APC3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ttll9A2APC3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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