Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb4A2A863 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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