Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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