Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Hdac6Q9Z2V5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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