Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms