Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Lgr5Q9Z1P4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Lgr5Q9Z1P4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lgr5Q9Z1P4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lgr5Q9Z1P4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lgr5Q9Z1P4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms