Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx1Q9WV80 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx1Q9WV80 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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