Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam50bQ9WTJ8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam50bQ9WTJ8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms