Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TapbpQ9R233 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms