Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnt3Q9QZ47 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms