Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Copg2Q9QXK3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms