Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col5a3Q9JLI2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms