Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr5Q9JLF7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms