Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Habp4Q9JKS5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms