Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Gfra4Q9JJT2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfra4Q9JJT2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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