Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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