Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SelenofQ9ERR7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms