Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg9Q9DB90 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg9Q9DB90 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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