Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms