Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Usp12Q9D9M2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Usp12Q9D9M2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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