Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmigd1Q9D7L8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms