Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Capns2Q9D7J7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Capns2Q9D7J7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms