Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms