Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms