Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D2Q3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms