Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms