Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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