Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP9

Prr23a3, Proline-rich protein 23A3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr23a3Q9CWP9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Prr23a3Q9CWP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Prr23a3Q9CWP9 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms