Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Pfdn1Q9CWM4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfdn1Q9CWM4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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