Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nudt21Q9CQF3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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