Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpa3Q9CQ71 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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