Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
StambpQ9CQ26 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms