Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim26Q99PN3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms