Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gtf2ird2Q99NI3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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