Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ms4a4dQ99N05 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms