Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gins4Q99LZ3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms