Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nmd3Q99L48 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nmd3Q99L48 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms