Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms