Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms