Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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