Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms